几乎所有标榜不施农药和化肥的“有机蔬菜”都必须依靠有机肥，而有机肥当中又有相当一部分来自家禽家畜等动物（包括人类）的粪便，这就给消费者提出了一个新问题：动物吃下去的抗生素到底有多少会随着排泄物排出体外？其中又会有多少进入蔬菜中？
全球每年消耗的抗生素有90%以上都被用在了畜牧业
事实上，畜牧业对人体健康最大的危害来自该行业内普遍存在的一项潜规则：抗生素的滥用。
抗生素不但能让动物少生病，还能让动物少吃饲料多长肉，所以大多数饲养场的老板都很乐意使用抗生素。据统计，目前全球每年消耗的抗生素有90%以上都被用在了畜牧业，其中大部分被作为添加剂加入到饲料中。仅在美国，每年就有超过1万吨抗生素进入了家禽家畜的体内，然后再被运到各个国家超市里的肉制品和奶制品柜台上。
滥用抗生素能加速有害细菌产生抗药性，导致常规的抗生素治疗失效，其潜在后果远比三聚氰胺更加严重。前几年曾经在西方国家引发恐慌的“超级病菌”（MRSA，一种能抗多种抗生素的金黄色葡萄球菌）就是滥用抗生素导致的恶果。
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