若检测时不需要液体增菌，则可用选择性培养基直接计数，若使用液体复苏或增菌操作步骤，则可用改进的多管计数法进行定量检测，对照MPN值表可得出检测结果。使用这种方法时，对样品至少要进行3个稀释度的稀释。
用液体增菌时，也可遵循沙门氏菌委员会的方案和标准取样计划。该委员会建议每个样品单位为25g并遵循下面的简化公式取样:
n=(-2.3/d)log(1-p)
式中n——所取样品的数量
若所有的测试管均为阴性结果，就意味着当置佶区间为p时，整批样品中阳性样品的平均数小于d。对于95%的置信区间：n≈3/d
将所取的样品混合后检验，能得到较可信的结果。在一批食品中随机抽取n份样品，检测前，对样品进行混合。例如，抽取30份样品（n=30），每份样品重25g；同样也可以取3份样品，每份250g。尽管样品的总质量相同，但采用不同的取样方法，在检测时间和培养基等耗材的用量上会有很大差别，所以制定取样计划时要认真考虑这些因素。
分离致病菌时使用较为广泛的另一种方法是疏水格滤膜法(HGMF)，这种方法能对样品的单个稀释度进行MPN值计数。检测时可以将薄膜从一个培养基转接到另一个培养基，从而合并了复苏和前增菌操作步骤。但在用这种方法检测沙门氏菌时，假阴性结果很高，达到了 3代，而且也不节省检测时间，因此他们不建议用这种方法检测沙门氏菌或对其进行计数。
