许多霉菌的次级代谢产物是从初级代谢产物异戊二烯缩合而成的，常见的衍生物有：三单元缩合产物倍半萜（sesquiterpenes）、由四聚物分解的二萜及固醇。类异戊二烯类抗生素的碳架构与类似初级代谢产物的已知结构基本一致，但是由于碳链的成环、各种重排及其他反应，这类抗生素的结构变化很多。唯一的一种临床应用的抗生素梭链孢酸的生物合成途径与霉菌膜的固醇合成类似。

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